【摘 要】
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目的利用生物信息学分析初步探索颈动脉粥样硬化进展的枢纽基因和关键通路。方法从GEO数据库获得颈动脉斑块的基因表达谱GSE43292数据集,利用GEO2R分析颈动脉斑块和正常组织
【基金项目】
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福建省卫生厅青年科研课题基金(2012-2-29)。
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目的利用生物信息学分析初步探索颈动脉粥样硬化进展的枢纽基因和关键通路。方法从GEO数据库获得颈动脉斑块的基因表达谱GSE43292数据集,利用GEO2R分析颈动脉斑块和正常组织的差异基因,利用R语言clusterprofile包对差异基因进行GO富集分析和KEGG功能富集分析。利用STRING工具和Cytoscape构建蛋白互作网络,并筛选关键基因。结果GEO2R分析GSE43292数据集共含有97个差异基因,包括46个上调基因和51个下调基因;基因富集分析发现差异基因主要富集cAMP信号通路、色氨酸代谢
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