胃癌中IRX1基因的表达及生物信息学功能预测

来源 :上海交通大学学报(医学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:shidai19860115
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目的研究胃癌中同源盒基因IRX1的表达并分析该基因的结构与功能特征。方法从NCBI基因数据库中提取IRX1基因(NM-024337)编码序列及夕端转录起始点上、下游各3000bp,利用生物信息学程序进行基因结构与蛋白同源性分析;对7株人胃癌体外培养细胞株及57例胃癌采用半定量RT—PCR方法检测IRX1基因mRNA表达。结果IRX1基因转录起始点上游富含CpG岛;基因编码蛋白质含有HOX与IRO两个模序,3’端第400~450氨基酸为富含脯氨酸区域;
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