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二氧化氯由于其广谱、高效的杀菌能力，被公认是当今国际上含氯类消毒剂产品中唯一高效的杀菌消毒剂。在较低的质量浓度下，二氧化氯短时间内即可杀灭绝大多数的微生物，包括细菌芽孢、繁殖体、分枝杆菌、真菌和病毒等。二氧化氯是通过对细菌细胞壁较强的吸附穿透能力而进入细菌细胞内，其极强的氧化能力可以有效地氧化细胞内含有巯基的生物酶，使其失去生物活性，并可以迅速的抑制细胞内蛋白的代谢、合成，从而引起微生物的死亡。