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三江源区作为“两江一河”的发源地、我国重要的水源补给区和涵养区,近年来出现了草场退化、土地沙化、水土流失等生态问题。我国现行的国家重点生态功能区转移支付和退耕还林还草、公益林保护等财政政策存在补偿主体单一、补偿资金规模小、考核激励和绩效评价体系不完备等弊端。建议从明确横向转移支付的主体和对象、界定转移支付的范围和标准、拓宽转移支付的路径和方式、完善转移支付的考核激励机制和绩效评价体系等方面探索建立三江源流域生态补偿横向转移支付制度,以作为中央财政纵向转移支付的有益补充。