基于大数据库寻找皮肤T细胞淋巴瘤潜在治疗药物

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目的:通过基于大数据库的生物信息学分析,寻找皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)治疗新方法。方法:通过重新质控并整合分析CTCL细胞经罗米地辛处理前、后的基因表达谱(GSE110248),筛选差异表达基因,通过DAVID数据库进行GO分析和KEGG信号通路富集;将差异基因导入Connectivity Map(CMap)数据库获得可对差异基因产生作用的药物分子,结合SubpathwayMiner软件包对CMap数据库中药物分子作用数据进行通路分析的结果筛选药物分子作用通路;利用STRING和Cytoscape 3.
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