利用生物信息学分析方法研究糖酵解相关基因在宫颈癌组织中的表达谱

来源 :当代医药论丛 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lijie04113209
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:利用生物信息学分析方法研究多个糖酵解相关基因在宫颈癌组织中的表达谱.方法:从TCGA数据库官网下载宫颈癌转录组测序数据,从GSEA数据库下载与糖酵解相关的基因集.提取TCGA数据库宫颈癌组织样本中糖酵解相关基因转录组表达谱数据.筛选出宫颈癌组织的差异基因.对这些差异基因进行GO功能和KEGG通路富集分析.利用string构建这些基因的蛋白互作网络,并用cytoscape软件中的cytohubba插件对这些差异基因进行蛋白互作网络分析.根据degree值筛选蛋白互作网络中的核心基因.结果:从TCGA数据库宫颈癌组织样本中筛选出了76个与正常宫颈组织基因存在差异的糖酵解相关基因.这些差异基因显著富集在与能量代谢相关的功能和通路上.在这些差异基因中,有CDK1、NDC1、NUP107、PFKM、IGF1和HK2六个可识别的蛋白互作网络核心基因.结论:宫颈癌组织中存在多个与正常宫颈组织基因存在差异的糖酵解相关基因.这些差异基因显著富集在与能量代谢相关的功能和通路上.在这些差异基因中,有CDK1、NDC1、NUP107、PFKM、IGF1和HK2六个可识别的蛋白互作网络核心基因.
其他文献
目的:探讨用去甲肾上腺素联合垂体后叶素治疗脓毒性休克的临床效果.方法:选择2020年1月至10月期间贵阳市云岩区黔灵医院收治的64例脓毒性休克患者作为研究对象.将这64例患者
如何当好新时代的小学班主任、尽快地适应新课标所倡导的“为了每一个学生的发展”的核心理念,已经成为当前小学教师和广大语文教育工作者关注的热点问题,我认为:教师要为人
目的 探讨腺病毒载体(Ad-DDAH2)转染大鼠脂肪干细胞(ADSCs)的可行性.方法 构建Ad-DDAH2-GFP质粒.原代培养大鼠ADSCs,流式细胞术检测免疫表型CD29、CD45、CD90表达情况.以不同
高耗低效成为中学写作教学的一大难题。究其原因是多方面的,但不容忽视的是语文教师在作文教学中没能激活学生的写作兴趣。怎样才能让写作“活”起来呢?我在教学中总结了以下
目的:分析并比较用莫西沙星与左氧氟沙星治疗耐多药肺结核的效果。方法:选取2019年1月至2020年5月广东省中山市第二人民医院收治的78例耐多药肺结核患者作为研究对象。随机将其分为莫西沙星组(39例)与左氧氟沙星组(39例)。对两组患者均进行常规的抗结核治疗,在此基础上分别采用莫西沙星与左氧氟沙星对莫西沙星组患者与左氧氟沙星组患者进行治疗,然后比较两组患者的临床疗效及不良反应的发生率。结果:莫西沙星组患者与左氧氟沙星组患者治疗的总有效率分别为97.44%与79.49%,二者相比差异有统计学意义(P<
随着新课改的影响,阜新市开展以小组合作学习为核心的自主高效课堂教学已有三年之久,所谓“自主高效课堂”,就是以课堂教学为切入点,打破以往教师问,学生答,教师唱“主角”,
目的:探讨并分析用阿维A胶囊联合卡泊三醇软膏治疗寻常型银屑病的效果及安全性.方法:选择万宁市人民医院皮肤科2018年10月至2019年11月期间接诊的62例寻常型银屑病患者作为研
目的:探讨并分析用依达拉奉联合尼莫地平治疗脑外伤的效果.方法:选择广西灵山县人民医院2018年6月至2019年6月期间收治的28例脑外伤患者作为研究对象.按照随机数表法将其分为
目的:分析非勺型高血压(NDH)患者在夜间睡前服用苯磺酸氨氯地平进行治疗的效果.方法:将2018年10月至2020年10月期间平凉市第二人民医院收治的100例NDH患者作为研究对象.将这1
体育这门课程不同于其他学科,在体育课堂中师生互动、教与练的密切配合贯穿于整个课堂。上体育课的时候,我们都是在室外进行的,所以很多同学对体育这门课很是喜欢,因为它不用
期刊