番茄YABBY基因家族的生物信息学分析

来源 :东北农业大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wangchongzhan
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YABBY基因家族是植物特有转录因子,与植物形态有关,在植物叶和花器官发育过程中起重要调控作用。试验在番茄基因组范围内鉴定出9个YABBY基因家族成员,分别位于第1、5、6、7、8、11和12号染色体。利用MEGA程序对番茄、拟南芥、大白菜和玉米YABBY基因家族作进化分析,进化树可分为四个亚组;利用GSDS程序分析基因结构保守性,显示SlYABBY基因内含子保守5~6个;MEME程序作基序分析,显示SlYABBY基序保守,经鉴定所有SlYABBYs均具有C2C2锌指结构域及YABBY结构域。运用plan
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