电喷雾离子阱质谱法研究蛋白与小分子配体间非共价结合的方法学探讨

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以小檗碱与α1-酸性糖蛋白间的非共价结合作用为例,提出了一种新的质谱滴定法。其主要假定条件是:当蛋白与小分子配体间有一定亲合力、且作用配体的摩尔量大于作用蛋白的摩尔量时,蛋白复合物总浓度与作用蛋白总浓度近似相等。通过不同摩尔量比的小檗碱对α1-酸性糖蛋白的电喷雾离子阱质谱(ESI—IT/MS)滴定实验,分析小檗碱与α1-酸性糖蛋白复合物的结合特点,并应用荧光法进行验证。结果表明应用质谱滴定法与荧光法得到的小檗碱与α1-酸性糖蛋白复合物的结合特性常数(如稳定常数、结合位点数、作用力类型)基本相同。与传统质谱
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