杨树天冬氨酸转氨酶基因家族鉴定及表达分析

来源 :南方农业学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：lyh327

【摘要】

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【目的】鉴定杨树天冬氨酸转氨酶(ASPAT)基因家族成员,并检测其组织表达特异性,为研究ASPAT在杨树初级氮素同化中的生物学功能提供参考依据。【方法】从杨树基因组数据库中筛

【作者】

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王宇晨曲春浦刘关君

【机构】

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东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室

【出处】

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南方农业学报

【发表日期】

：

2019年3期

【关键词】

：

杨树天冬氨酸转氨酶(ASPAT) 基因家族生物信息学基因表达

【基金项目】

：

国家自然科学基金项目(31570648,31600534)

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【目的】鉴定杨树天冬氨酸转氨酶(ASPAT)基因家族成员,并检测其组织表达特异性,为研究ASPAT在杨树初级氮素同化中的生物学功能提供参考依据。【方法】从杨树基因组数据库中筛选鉴定ASPAT基因家族成员,利用生物信息学软件分析各基因家族成员序列和基因结构及编码蛋白的理化性质、亚细胞定位和保守基序等,并利用实时荧光定量PCR检测正常施氮处理(1mmol/L NH4NO3)下其在杨树根、茎和叶中的组织表达特异性。【结果】从杨树基因组中共鉴定出9个ASPAT基因家族成员,包括7个真核型ASPAT(AAT)基因(

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