多肽序列的结构特征与其免疫原性关系的研究

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拟建立Th细胞表位预测的自动化、程序化方法.从多肽序列的一级结构出发,将各氨基酸侧链看成一个整体即拟原子,并基于多肽序列中氨基酸侧链间距离和氨基酸侧链的电性特征,构建了能描述多肽序列结构特征的序列特征矢量,简称ζ矢量.选取文献中MHC限制性为14个Ad限制性和14个非Ad限制性多肽序列,分别定义为活性和非活性肽,并以之作为训练集来建立Th细胞表位预测的定量模型.为检验该预报系统的精确性,进行了随机抽样检验和交互检验,结果表明,该预报系统具有稳定性好、预测能力强的特点,该方法还可推广用于人的MHC Ⅰ、Ⅱ类
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