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为了研究Nafion膜的微细观结构及其输运特性，本文针对目前广为采用的Nafion 117膜并基于Materials Studio（MS）软件平台构建了一种分子动力学计算模型，对其实施了计算，得到了不同含水量下Nafion117膜的晶胞结构，膜晶胞的密度的模拟值与实验值吻合较好；同时研究了水分子和水合氢离子在膜内的扩散，水分子和水合氢离子的扩散系数随着含水量的增加而增加，和实验值变化趋势一致。分析了计算结果与文献实验值出现偏差的原因，并指出目前利用分子动力学方法对质子交换膜（PEM）进行微观研究仍不失为有力的手段。