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我国自然保护区现行保护政策存在的问题主要表现为体制问题和利益分配平衡问题。根据定量计算成本一效益以及评价与分析综合效益，认为可从两方面优化现行保护政策：一是针对各部分效益要采取措施，特别是生态效益优化的政策要重视生态补偿机制的研究等。二是针对成本效益评价的结果采取相应的优化措施：重视利益的合理分配，完善社区参与机制，实施区域经济政策的改革。研究结果为秦岭地区自然保护区政策的调整提供参考，为促进区域与自然保护区的协调发展提供理论支撑。