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在内蒙古畜牧业快速发展的同时，畜禽疫病的防治也得到了长足发展，并取得了令人瞩目的成绩。但是，由于疫病的顽固性、适应性、反复性、变异性和突变性，目前仍有200多种疫病困扰着畜牧业由粗放型向集约型、由数量型向效益型转变。21世纪内蒙古将进入新一轮疫病频发期，因此，必须树立发展和保护并重的思想，建立了预防为主，防检结合，以检促防的畜禽疫病防治工作运行机制，适应畜牧业发展的需求。