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利什曼原虫虫种复杂，致多种形式的利什曼病，且其媒介也具多样性，正确鉴定利什曼原虫对及时治疗和制定有效的控制策略至关重要。该文介绍了同工酶酶谱分析、单克隆抗体、核型分析、核酸杂交、基因测序、限制性片段长度多态性（RFLP）、随机扩增多态性DNA（RAPD）、微卫星DNA等分子技术和方法在利什曼原虫虫株鉴定和系统发生研究中的应用及进展情况。