【摘 要】
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目的通过构象搜索,得到Titin蛋白EVK片段中PVAP基序的低能构象.方法利用分子力学随机构象搜索法和混合MonteCarlo方法,对Titin蛋白PEVK片段中的PVAP基序进行构象搜索.结果随
【机 构】
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武警医学院化学教研室,天津师范大学化学与生命科学学院无机与分析教研室
【基金项目】
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Tianjin Natural Sci. Found，武警总部科研项目
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目的通过构象搜索,得到Titin蛋白EVK片段中PVAP基序的低能构象.方法利用分子力学随机构象搜索法和混合MonteCarlo方法,对Titin蛋白PEVK片段中的PVAP基序进行构象搜索.结果随机构象搜索得到的低能构象集中,PVAP的构象骨架分为折叠式和伸展式,其中以折叠式为优势构象;利用混合Monte Carlo方法得到的低能构象与随机构象搜索结果基本一致.结论在拉力作用下,PVAP的构象由折叠式转变成伸展式,使分子在宏观上表现为弹性,为解释其对Titin蛋白弹性的贡献提供了一定的理论依据.
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