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限制性两阶段多位点全基因组关联分析法在遗传育种中的应用

来源 :中国农业科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：whsvlsy

【摘 要】

：

全基因组关联分析(genome-wide association studies,GWAS)通过建立全基因组高密度分子标记以检测基因型与表型间的关联性,已成为动植物数量性状遗传解析的主要方法。然而,以

【作 者】

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贺建波 刘方东 王吴彬 邢光南 管荣展 盖钧镒 

【机 构】

：

南京农业大学大豆研究所/国家大豆改良中心/农业部大豆生物学与遗传育种重点实验室/作物遗传与种质创新国家重点实验室/江苏省现代作物生产协同创新中心

【出 处】

：

中国农业科学

【发表日期】

：

2020年9期

【关键词】

：

全基因组关联分析 复等位变异 SNPLDB标记 多位点模型 QTL-allele矩阵 restricted two-stage multi-locus geno 

【基金项目】

：

国家自然科学基金(31701447),国家作物育种重点研发计划(2017YFD0101500,2017YFD0102002),长江学者和创新团队发展计划(PCSIRT_17R55),教育部111项目(B08025),中央高校基本科研业务费项目(KYT201801),农业部国家大豆产业技术体系CARS-04,江苏省优势学科建设工程专项,江苏省JCIC-MCP项目

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全基因组关联分析(genome-wide association studies,GWAS)通过建立全基因组高密度分子标记以检测基因型与表型间的关联性,已成为动植物数量性状遗传解析的主要方法。然而,以往GWAS方法只注重于个别主要QTL的检测,而且使用仅有2个等位变异的SNP标记不能检测自然群体中广泛存在的复等位变异,一定程度限制了GWAS的应用。限制性两阶段多位点全基因组关联分析方法(RTM-GWAS)首先根据全基因组高密度SNP标记间的连锁不平衡程度,将多个相邻且紧密连锁的SNP标记组成为具有复等位变

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