【摘 要】
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目的:探讨利用单细胞RNA测序技术研究膀胱癌患者外周血特征的效果,为研究膀胱癌患者外周血提供新的策略.方法:分别收集膀胱癌患者和健康人的外周血,提取外周血单个核细胞(PBM
【机 构】
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广西医科大学 基因组与个体化医学研究中心,南宁 530021;广西医科大学 广西生物医药协同创新中心广西—东盟重大疾病防治协同创新中心,南宁 530021;广西医科大学 广西基因组与个体化医学研究重点
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目的:探讨利用单细胞RNA测序技术研究膀胱癌患者外周血特征的效果,为研究膀胱癌患者外周血提供新的策略.方法:分别收集膀胱癌患者和健康人的外周血,提取外周血单个核细胞(PBMC)进行单细胞RNA测序.对测序结果进行差异基因分析,根据基因表达情况降维聚类分群,定义各细胞亚群的细胞类型和比较各亚群之间的差异.结果:单细胞RNA测序检测到健康人PBMC有7 523个细胞,膀胱癌患者PBMC有5 289个细胞,根据上述细胞的基因的表达情况将细胞聚类分为15个亚群.健康人和膀胱癌患者的PBMC细胞类型具有相似性但细胞亚型的分布具有差异性,尤其是CD8+和CD4+T细胞,并且在膀胱癌患者PBMC中发现了膀胱癌患者特有的细胞亚群.结论:单细胞RNA测序能够实现对PBMC做到精细分群,通过展示来自健康人和膀胱癌患者PBMC的表达谱,能够更精准的反映PBMC细胞间的差异,为研究膀胱癌患者PBMC提供了一个新的研究方案.
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