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文章阐述了限制性片段长度多态性(RFLP)、随机扩增多态性DNA(RAPD)、扩增片段长度多态性(AFLP)、分子原位杂交(ISH)等几种分子标记的原理以及在棉花育种研究中的应用,可用于建立品种的指纹档案,保护品种专利;对重要农艺形状进行早期鉴定,缩短育种时间;应用分子标记构建棉花的遗传图谱,提高育种工作的预见性.