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烟草ESTs数量迅速增加为开发新的SSR标记提供了宝贵的资源。经过软件分析,对242683条烟草ESTs序列剔除冗余序列,在211728条非冗余烟草ESTs序列中,共检索出9339个SSR,SSR之间的距离约为14.21kb,检出率为4.41%,包括216种重复基元。其中三核苷酸重复类型的SSR占主导地位,占总SSR的50.34%,其次为二核苷酸和单核苷酸,分别为23.00%,16.48%,其余重复类型所占比例均不足5%。在所有重复基元中,A/T重复为主要类型,占所有重复14.68%,其次为AT/TA、A