目的 通过流行病学调查和基因测序，对四川省成都市一起新冠病毒（SARS-CoV-2）疫苗接种点疑似感染者核酸检测阳性样本进行基因溯源，为SARS-CoV-2疫苗接种点防控工作提供建议。方法 对2021年2月24日四川省成都市A区B医疗机构报告的1例SARS-CoV-2疫苗接种点疑似感染者进行流行病学调查，对该患者及其密切接触者、所处环境、B医疗机构环境、医务人员的工作服进行样本采集及实验室核酸检测，并对阳性样本进行二代基因测序及溯源分析。结果 2021年2月23日该患者因咳嗽、喉痒、流涕症状就诊于B医疗机构（疫情期间承担SARS-CoV-2疫苗接种和样本采集工作）并于当日进行SARS-CoV-2核酸采样,结果呈阳性。流行病学调查结果显示，该患者及其密切接触者14 d内均无境外旅居史、无新冠肺炎（COVID-19）确诊/疑似患者接触史和SARS-CoV-2暴露史，其亦无SARS-CoV-2疫苗接种史；该患者SARS-CoV-2核酸检测阳性样本与B医疗机构接种点的SARS-CoV-2疫苗样本序列同源性高达99.99%,Pangolin分型同属B型。结论 该疑似感染者不符合新冠肺炎确诊病例或无症状感染者相关国家诊断标准，其SARS-CoV-2核酸检测阳性样本可能为B医疗机构疫苗接种点工作人员携带或穿着已被SARS-CoV-2疫苗污染的物品或防护服等进行核酸采样时所致。因此，建议基层医疗机构将新冠疫苗接种和样本采集人员分岗工作，严格遵守接种规范和操作规程，避免因疫苗污染所致的假阳性样本。