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大豆花叶病毒基因组结构与其它马铃薯Ｙ病毒组成员一样，是一条单链天意ＲＮＡ，全长约１００００个核苷酸，整个基因组按一个阅读框架翻译，产生一个多聚蛋白前体，并通过蛋白酶切加工，形成不同功能的成熟蛋白：３５Ｋ（Ｐ１），ＨＣ，４２（Ｐ３），ＣＩＰ，６Ｋ，２１Ｋ（Ｖｐｇ），２７Ｋ（ＮＩａ），Ｎｉｂ，ＣＰ。基因组翻译产物的加工由三种病毒蛋白酶的参与，即：Ｐ１（３５Ｋ），ＨＣ和２７Ｋ（ＮＩａ），酶切加工产生的各