【摘 要】
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通过高通量测序分析1株能够促进地黄生长及次生代谢产物积累的内生尖孢镰刀菌的基因组结构,推测其内生及促生机制.使用Illumina Hiseq X ten双端测序技术对内生真菌GG22进行基因组测序,并进行生物信息学分析.分析结果,共得到17296个预测的基因,其中基因的总长度26937813 bp,平均基因长度为1557.4 bp.与KOG、KEGG、Swiss-Prot、TrEMBL、Nr及Pfam常用功能数据库进行BLAST比对,共有17202个基因得到功能注释,注释率为99.46%,其中有3801个
【机 构】
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河南中医药大学药学院,河南郑州450046;呼吸疾病中医药防治省部共建协同创新中心,河南郑州450046;河南中医药大学药学院,河南郑州450046
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通过高通量测序分析1株能够促进地黄生长及次生代谢产物积累的内生尖孢镰刀菌的基因组结构,推测其内生及促生机制.使用Illumina Hiseq X ten双端测序技术对内生真菌GG22进行基因组测序,并进行生物信息学分析.分析结果,共得到17296个预测的基因,其中基因的总长度26937813 bp,平均基因长度为1557.4 bp.与KOG、KEGG、Swiss-Prot、TrEMBL、Nr及Pfam常用功能数据库进行BLAST比对,共有17202个基因得到功能注释,注释率为99.46%,其中有3801个基因注释到KEGG数据库中;7431个基因注释到KOG数据库中;11548个基因注释到Pfam数据库中;9007个基因注释到Swissprot数据库中;17201个基因注释到TrEMBL数据库中,且分别有881、5247、158个基因被注释到CAZyme、PHI、TCDB数据库.基因功能分类分析发现,尖孢镰刀菌GG22的细胞运动和细胞外结构不发达,这可能是其成为地黄块根寄生内生菌的原因之一.基因簇分析得出,GG22可能能够产生碧卡维林等化合物而抑制其他微生物的生长,同时保护寄主植物免受其他病原菌的侵害,成为地黄促生内生真菌.通过对GG22基因组结构进行分析,初步获得了其内生性生物学基础,为进一步阐明其促进地黄生长及次生代谢产物积累奠定了基础.
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2019年,以湖南农业大学选育的JX0010为供试材料,开展播期(5月24日、6月3日)、播种深度(2、4 cm)和覆盖物(基质、50%基质+50%耕作层土壤、耕作层土壤)的三因素再裂区试验,研究不同播种方式对棉花出苗率、产量及纤维品质的影响.结果表明:6月3日播种、播种深度为2 cm时,采用混合土覆种,其出苗率和出苗穴率均最高,分别达88%和95%;播期对单株铃数存在显著影响,随着播期的推迟,单株铃数减少;覆盖物对马克隆值有显著影响,用50%基质+50%耕作层土壤作为覆盖物,其马克隆值较低,可纺性能较好
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