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医院感染常见耐药菌，如甲氧西林耐药性金黄色葡萄球菌和甲氧西林耐药性凝固酶阴性葡萄球菌的耐药特点是对所有β-内酰胺类抗生素耐药，并常对氟喹诺酮类，氨基糖苷类，大环内酯类，克林霉素和四环素耐药，抗菌药可用万古霉素，去甲万古霉素，替考拉宁，对万古霉素耐药性肠球菌，根据药敏结果，联合用药，青霉素耐药性肺炎链球菌，治疗上可选用第三代头孢菌素类，大剂量阿莫西林+酶抑制剂，铜绿假单胞菌呈多重耐药性，对其抗菌活性较强的药物有头孢他啶，哌拉西林/三唑巴坦，亚胺培南/西司他丁，阿米卡星等。大肠埃希氏菌和肺炎克雷伯氏菌产超广谱