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通过4株于相近时间不同地区分离到的甲3亚型（H3N2）病毒株HA1区的核苷酸序列分析，研究HA1区核苷酸序列的差异与病毒株抗原性及流行病学间的关系。结果表明，4株病毒来源于同一祖先，证实了甲型流感病毒亚型内新变种是由一处出现，而后逐步蔓延开，而不是多处同时出现。结果还证明了，甲型流感病毒同一亚型内病毒株间HA1区不同位置氨基酸的改变不具有同等的流行病学上的意义：如果氨基酸的改变是发生在病毒颗粒HA结构的顶部（HA1）即抗原决定簇区，则往往造成新变种出现而具有流行病学上的意义，并能用常规的抗原分析测定显示出来，例如1987年的A／雅防／2/87（H3N2）与1989年4株甲3亚型毒株间的重要位点上氨基酸的差异；如果此氨基酸的改变不是发生在抗原决定簇区，则一般不具有流行病学上的意义而用常规的抗原分析法显示不出，例如4株1989年甲3亚型毒株间的差异。这也指出了，常规的抗原分析法仍为当今流感监测中极为重要和不可缺少的一种手段。