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针对海底可控源电磁法（CSEM）正演计算中所涉及到的极低频电磁波在含有目标体的不均匀分层介质中的传播问题，提出了基于“扰动”的格林函数算法。该算法将发射源在目标体内产生的初级场直接作为接收点处次级场的激励源，结合并矢格林函数的物理意义对次级场进行计算，从而避免了矩阵方程的求解。验证结果表明：当目标体相对于背景介质为“微扰”时，计算精度可接受。最后，给出了目标体位于不同位置时次级场幅值的2-D分布图，从图中可以明显看出目标体的分布位置及大小对于目标体的作用区域及大小的影响，为反演的进行提供了依据。