政府补贴与企业技术创新之间的不确定关系是补贴政策制定和研究的热点问题,本文在内生性沉没成本理论的框架下,构建企业研发模型,分析不同的政府补贴模式对企业创新产出的激励效果。研究发现,政府补贴对企业的创新激励会受到补贴的持续性与否和企业研发性沉没成本的影响,不同的补贴模式会改变企业预期,从而影响补贴的效果。本文使用153家公司2007~2012年的平行面板数据,采用自体抽样法检验了政府补贴对具有不同研发性沉没成本企业创新产出的激励效果,发现了显著的组间差异。实证结果表明,在战略性新兴产业中,临时性政府补贴模式对企业创新总产出有显著积极影响。在考虑到企业差异的情况下,研发性沉没成本低的企业,政府补贴与企业创新产出之间的正相关系数为0.8305,而研发性沉没成本高的企业,由于受到盈利目标的限制,企业在竞争压力下研发积极性会下降,政府补贴的效果不显著。