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双孢菇原种和栽培种，体积大，数量多，不可能放在冰箱内大量保存，且长时间的保藏会影响其生活能力，一般都应按计划生产，长好后及时使用，不宜长期保藏。但自己生产或购来原种和栽培种，往往不可能马上就用，必须进行短时间的保存。要保存的原种，必须菌丝粗壮，生活力强，瓶盖严密，无杂菌感染；要保存的栽培种，必须菌丝茁壮，菌柱不应与瓶壁分离，不得有污染或出黄水的衰老现象。把挑出的符合保存标准的原种和栽培种，放人保存室内，保存室的条件应该是干净、凉爽、干燥、黑暗，以降低其生命活动，