【摘 要】
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本研究以万安玻璃红鲤鱼为材料,通过同源克隆的方法克隆了万安玻璃红鲤鱼双链RNA激活的蛋白激酶(PKRCcvwPKR),并首次克隆到CcvwPKR的剪接异构体.CcvwPKR全长为2145 bp,编码714个氨基酸,CcvwPKR剪接异构体全长1431 bp,编码476个氨基酸.CcvwPKR的剪接异构体是CcvwPKR第477个密码子的G突变为T(gaa477taa),从而使得CcvwPKR的翻译提前终止.氨基酸序列比对和空间结构SMART预测显示,CcvwPKR和CcvwPKR剪接异构体都含有三个双链R
【机 构】
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井冈山大学医学部,江西,吉安 343009;吉安县疾病预防控制中心,江西,吉安县 343100;井冈山大学医学部,江西,吉安 343009;南昌大学抚州医学院,江西,抚州 344000
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本研究以万安玻璃红鲤鱼为材料,通过同源克隆的方法克隆了万安玻璃红鲤鱼双链RNA激活的蛋白激酶(PKRCcvwPKR),并首次克隆到CcvwPKR的剪接异构体.CcvwPKR全长为2145 bp,编码714个氨基酸,CcvwPKR剪接异构体全长1431 bp,编码476个氨基酸.CcvwPKR的剪接异构体是CcvwPKR第477个密码子的G突变为T(gaa477taa),从而使得CcvwPKR的翻译提前终止.氨基酸序列比对和空间结构SMART预测显示,CcvwPKR和CcvwPKR剪接异构体都含有三个双链RNA结合模体(dsRBM),CcvwPKR剪接异构体缺失PKR的C端的激酶结构域.系统进化分析表明,万安玻璃红鲤鱼PKR在进化上与鲤鱼和鲫鱼密切相关.万安玻璃红鲤鱼和目前已有研究的鲤科鱼类PKR一样,分子结构都含有三个dsRBM,三个dsRBM使得其具有更强的结合dsRNA的作用,推测可能与其较强的抗病能力有关.
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