【摘 要】
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采用4种不同的方法,分别提取了同一来源的50 mL、200 mL和1 000 mL海水样品的基因组DNA,利用紫外分光光度法测定DNA质量和纯度。研究发现:方法 1(使用PIPES缓冲液)和方法 2(
【机 构】
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中国海洋大学海洋生命学院,中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所,
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采用4种不同的方法,分别提取了同一来源的50 mL、200 mL和1 000 mL海水样品的基因组DNA,利用紫外分光光度法测定DNA质量和纯度。研究发现:方法 1(使用PIPES缓冲液)和方法 2(使用TENS缓冲液)所提取的DNA,其OD260/OD280和OD260/OD230很低(不足1.4);方法 3(使用STE缓冲液)及其改进后的方法 4(使用STE缓冲液,但利用机械作用取代酶消化作用来破碎细胞)所提取DNA的两个指标都较高(超过1.6),并且方法 4所得DNA的产率是其他3种方法的1.5～2.4倍。另外,检测方法 3和方法 4所提取DNA的PCR扩增效率,结果表明所提取DNA无需纯化就能进行高效PCR扩增反应。综合以上结果,从DNA浓度、纯度及PCR扩增效率可以看出,方法 4是适合于海水样品多样性研究的一种高效DNA提取方法。
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