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[期刊论文] 作者:刘翠,杨忠志,, 来源:分子科学学报 年份:2009
用ABEEMσπ/MM模型和MP2/6-31+G(d)//B3LYP/6-31G(d)方法研究水合效应对脂肪族氨基酸二肽的影响.从结构和能量两方面说明Leu残基在蛋白质中起成旋作用,Val和Ile残基在蛋白质中起解旋作用......
[会议论文] 作者:刘翠;杨忠志;, 来源:第十二届全国量子化学会议 年份:2014
  碱基对间的氢键作用和堆积作用,在稳定DNA 结构以及DNA 复制过程中扮演着重要角色.[1]氧化碱基的出现时刻威胁着基因信息的完整性,它与多种癌症联系在一起.本文发展了适...
[会议论文] 作者:刘翠,杨忠志, 来源:中国化学会第30届学术年会 年份:2016
  近些年,极化力场的发展及将其应用到DNA体系的研究十分活跃。深入研究DNA的损伤和修复机理,对了解相关疾病的起源、降低某些遗传病的发病率、降低DNA的损伤率和突变率至关...
[期刊论文] 作者:刘翠,杨忠志,, 来源:中国科学(B辑:化学) 年份:2009
应用ABEEMσπ/MM模型进行分子动力学模拟,研究了显性水溶液中小α-螺旋(短肽Ala5)折叠/展开的可逆过程.动力学分析显示,300K下α-螺旋可以保存2ns的时间,该结果支持Margulis等人的结论.每个结构与α-螺旋结构骨架重原子的均方根偏差的时间轨迹指出,"300K下螺旋......
[期刊论文] 作者:郭慈,刘翠,杨忠志,, 来源:物理化学学报 年份:2010
Na^+-G-四链体复合物是一个明显的极化体系,其形成或解离过程中,Na^+的移动路线目前还不十分明确.σπ水平的原子-键电负性均衡方法融合进分子力学(ABEEMσπ/MM)模型除原子位点...
[期刊论文] 作者:王晶晶,刘翠,杨忠志,, 来源:高等学校化学学报 年份:2013
将原子与键电负性均衡方法融人分子力学方法,即利用ABEEMσπ浮动电荷力场与ABEEM-7P水模型相结合的方法及OPLS-AA固定电荷力场方法,对GA88和GB88蛋白进行了水溶液(温度295K)和真...
[期刊论文] 作者:王华荣,刘翠,杨忠志, 来源:化学学报 年份:2010
结合鸟嘌呤四链体(G4)的结构特点,取G4中的一个K+与一片g-tetrad(g-tetrad-K+)为研究对象,和一个K+与两片g-tetrad(1,2-g-tetrads-K+和2,3-g-tetrads-K+)为研究对象.为g-tetr...
[期刊论文] 作者:宫利东,张娜,刘翠,杨忠志,, 来源:北华大学学报(自然科学版) 年份:2012
应用量子化学方法和原子-键电负性均衡方法(ABEEM)对Na+(H2O)n和K+(H2O)n(n=1~6)体系进行研究.采用MP2/6-31++G(d,p)方法进行几何构型的优化及频率的计算,在MP2/6-311++G(2d,2p)方法下计算了能量......
[期刊论文] 作者:张千慧,王阳,刘翠,杨忠志,, 来源:化学学报 年份:2014
遗传信息的完整性不断受氧化基因的威胁,7,8-二氢-8-氧鸟嘌呤(8-oxo-G)是氧化DNA损伤最常见的产物.氧化碱基会引起基因突变、癌变及衰老等.应用量子化学方法分析得出:鸟嘌呤(...
[期刊论文] 作者:宫利东,郑胜男,卜聪明,刘翠,杨忠志, 来源:辽宁师范大学学报:自然科学版 年份:2019
用MP2/6-311++^G**//B3LYP/6-311++G^**方法对(Urea)n(n=2~5)复合物进行结构优化、频率和结合能的计算,并考虑基组重叠误差.研究发现,(Urea)n(n=2~5)中存在N-H…O和N-H…N两...
[期刊论文] 作者:宫利东,寇英杰,黄香溢,潘一鸣,张霖,刘翠,杨忠志,, 来源:北华大学学报(自然科学版) 年份:2015
应用量子化学方法B3LYP/6-311+G(d,p),对气相团簇M(CH3OH)1~4(M=Be2+/Mg2+/Ca2+)的结构、能量进行计算,采用HF/STO-3G方法对电荷分布进行研究.结果表明,甲醇分子通过O原子配位于金属离子......
[期刊论文] 作者:潘一鸣,张静,田博,姚菁菁,宫利东,刘翠,杨忠志, 来源:高等学校化学学报 年份:2018
应用量子化学方法MP2/6-311++G(d,p)//B3LYP/6-31+G(d,p)和原子-键电负性均衡浮动电荷分子力场(ABEEM/MM),对[Na(H2O)n]+(n=3~8),[Na(NMA)n]+(n=3~8)和[Na(NMA)n(H2O)m]+(n+m...
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