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[学位论文] 作者:黄管大,, 来源:华南理工大学 年份:2004
生物序列分析中的基于k-mer的非比对统计算法作为对传统比对方法的补充和发展已逐渐成为生物信息学研究中的一个热点领域。非比对统计算法是将DNA或蛋白质的分子序列作为字(w...
[期刊论文] 作者:刘雪梅,黄管大,黄天来, 来源:华南理工大学学报:自然科学版 年份:2019
用非序列比对方法研究微生物菌群的分类是目前生物信息学中的一个热门领域.文中开发了一种基于k-mer统计的非序列比对软件SeqDistK.SeqDistK可通过开源网站https:∥github.co...
[期刊论文] 作者:刘雪梅, 李文, 黄管大, 黄天来, 叶宇中, 徐国皓,, 来源:华南理工大学学报(自然科学版) 年份:2019
在系统发育学中,构建系统进化树的算法是研究进化关系的基础.本文探讨并验证了基于k-mer的相异度算法d2S结合邻接法NJ构建系统进化树的可行性,对两种进化情景下的12个16S rRN...
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