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[会议论文] 作者:Xuewen Cui,Wenqiang Li,Simon See,James Lin, 来源:2014全国高性能计算学术年会 年份:2014
The Unified Memory in CUDA 6.0 is one of the most significant update in the history of CUDA.Before CUDA 6.0,existing programming model for GPU computing relies on programmers to explicitly manage data...
[期刊论文] 作者:赵铁柱,董守斌,Verdi MARCH,Simon SEE, 来源:软件学报 年份:2011
基于Lustre文件系统,对并行文件系统的性能评估和性能建模进行了研究.通过对性能因子的调研,进行了一系列性能评估实验,并提出性能相关性模~(PRModel).在实验评估和PRModel分析中发......
[期刊论文] 作者:司雨濛,韦建文,Simon SEE,林新华, 来源:计算机科学 年份:2017
Halo-based Galaxy Group Finder(HGGF)是一种有效的星系分组算法,它根据星系的空间位置、红移、质量等多种属性将星系分组,从而为星系组的形成与演化研究提供重要依据。但是,...
[期刊论文] 作者:韦建文,许志耿,王丙强,Simon SEE,林新华, 来源:计算机科学 年份:2017
宏基因组基因聚类是筛选致病基因的新型方法,其依赖于海量的测序数据、有效的聚类算法以及高效的计算机来实现。相关系数矩阵的计算是进行聚类前必须完成的操作,占总计算量的...
[会议论文] 作者:郭贵鑫,邱爽,王丙强,方林,Simon See, 来源:2013全国高性能计算学术年会 年份:2013
基因组数据在以空前的速度增长,其中,多数基因组数据文件格式以类似于表格的平文形式存储.为了合理利用资源,开发了一个基于GPU加速的基因组数据压缩框架.该框架包含了多种压缩算法在GPU上的高效并行化实现,通过为列数据选取合适方法进行压缩,在不损失压缩率的......
[会议论文] 作者:郭贵鑫,邱爽,林哲,王丙强,陆旭佳,方林,韦建文,林新华,Simon See, 来源:2014全国高性能计算学术年会 年份:2014
宏基因组主要研究特定环境中微生物的组成及与环境因素的交互关系,其任务之一是将不同基因按照样本特征进行聚类,进而研究各类之间的相互关系.由于样本量m-般在上千左右,每个...
[会议论文] 作者:郭贵鑫,陆旭佳,邱爽,林哲,王丙强,方林,韦建文,林新华,Simon See, 来源:2014全国高性能计算学术年会 年份:2014
宏基因组主要研究特定环境中微生物的组成及与环境因素的交互关系,其任务之一是将不同基因按照样本特征进行聚类,进而研究各类之间的相互关系.由于样本量m-般在上千左右,每个样本中包含的基因数量n也在百万左右,且符合数据特性的聚类算法复杂度为O(m2n2),常规实......
[会议论文] 作者:叶志强,卢冕,郭贵鑫,罗琼,王丙强,方林,Simon See,朱小谦,刘光明, 来源:2013全国高性能计算学术年会 年份:2013
基因组数据的快速增长,为群体遗传学研究积累大量第一手的宝贵信息,同时也对如何快速处理这些信息提出巨大的挑战.本文研究了一种新型群体变异检测方法中的动态规划迭代算法,首先将其转化为一系列的矩阵乘法,利用结合律发掘了并行性,接着设计了面向GPU架构的高......
[会议论文] 作者:Chun Teoh,Vincent Ming Shan Mak,Peggy Sau Kwan Chu,Chi Wai Man,Darren Ming Chun Poon,Ho Yuen Cheung,Simon See, 来源:第十三届亚洲泌尿外科学会年会(UAA2015)、第二十二届全国泌尿外科学术会议(CUA2015)、第十六届全军及武警泌尿 年份:2015
[会议论文] 作者:Sang Chan,Vincent Ming Shan Mak,Darren Ming Chun Poon,Ho Yuen Cheung,Peggy Sau Kwan Chu,Chi Wai Man,Simon See, 来源:第十三届亚洲泌尿外科学会年会(UAA2015)、第二十二届全国泌尿外科学术会议(CUA2015)、第十六届全军及武警泌尿 年份:2015
Previous studies on the risk of diabetes mellitus (DM) after androgen deprivation therapy (ADT) were largely based on Caucasians.We conducted this study to investigate the risk of DM, and risk factors...
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