浮动电荷模型相关论文
离子在众多化学和生命过程中发挥着不可替代的作用,揭示离子水合及其与生物分子的微观作用机制,是人们长期探索的重要课题[1],其......
动力学模拟方法已经成为探索生物体系规律和本质的一种重要的工具,其模拟的结果很大程度上取决于所采用的分子力场的优劣。目前广泛......
应用ABEEM-7P水分子模型,对由216个和500个水分子构成的液态水体系,使用周期性边界条件,在NVT、NPT系综下,进行分子动力学模拟。在......
利用ABEEM/MM浮动电荷模型对蛋白质BPTI分子的水溶液进行了分子动力学模拟,验证了模拟参数(包括ABEEM参数和力场参数)的正确性以及......
利用原子键电负性均衡结合分子力场方法(ABEEM/MM)对五种环多肽晶体进行了研究.与传统力场相比,该方法中的静电势包含了分子内和分子间......
基于量子化学(QM)计算和原子-键电负性均衡浮动电荷分子力场(ABEEMσπ/MM),构建了1,2-二棕榈酰磷脂酰胆碱(1,2-dipalmitoyl-sn-ph......
应用量子化学(QM)计算和原子-键电负性均衡浮动电荷分子力场(ABEEMσπ/MM)方法,建立1-棕榈酰-2-油酰基-磷脂酰乙醇胺(POPE)分子的......
将ABEEMσπ浮动电荷模型与generalized Born(GB)模型相结合,计算分子的溶剂化自由能.GB模型是一种连续介质模型,计算快速而简单,但......