解脂耶氏酵母代谢网络模型的构建与分析

来源 :2012工业生物过程优化与控制研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:bosimao_wang
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
  随着全球经济的迅速发展,能源日渐短缺的问题越来越突出,开发和利用可再生能源的需求也愈显迫切。微生物生产所获得的生物柴油是一类清洁的有潜力的新型替代能源。解脂耶氏酵母是模式产油脂酵母,具有较好的脂肪酸合成性能,然而针对该菌株的代谢网络解析以及途径工程改造的研究手段仍然有限。基于解脂耶氏酵母的全基因组序列,以KEGG、IMG、UniprotKB及Enzyme等数据库为基础筛选注释信息,加以合理的修正及整理,构建出该菌的基因组规模代谢网络。并通过VBA编程将网络模型转化成Matlab可读的数学模型,通过填补代谢网络缺口等最终构建出该产油脂模式菌株基因组规模代谢网络模型iYL619_PCP。该模型包含619个基因,847个代谢物,1148个反应,模型中添加了127个交换反应,240个运输反应及13个自发反应。利用该模型,通过计算机模拟预测了该菌株在29种不同培养基下的生长,准确率达83%。确定了该菌株的最小培养基,通过流平衡分析预测出该菌的143个必需基因,同时通过流扰动分析为构建该菌突变株作指导。该菌基因组规模代谢网络模型的构建及模拟仿真对于实际的菌株代谢工程改造具有一定的指导意义。
其他文献
  中国对虾的产量已经连续几年位居世界首位,2005年达到50万,其中南美白对虾的产量约占30-35万吨.目前我国南美白对虾产品主要以虾仁为主,每年对虾的加工过程中会产生大量
  在本研究中,我们通过电镜观察菌丝形态及胞内物质变化,同时检测胞内DNA和蛋白质含量,首先分析了S.hygroscopicus液体培养过程中的菌丝分化。电镜观察发现,在培养36h后胞内核
会议
  五环三萜类化合物的糖链、糖基及其去糖基对其生物活性有重要的影响。甘草酸(Glycyrrhizin)是植物甘草中最重要的天然产物,具有消炎、抗病毒和天然甜味剂等多重功效,是目前
  研究了不同溶解CO2 (dCO2)水平对谷氨酸发酵过程的影响.在谷氨酸合成期,通过调节进气CO2比例,控制dCO2水平为50、100、200、300mg/L,对发酵过程中谷氨酸合成、胞外副产物
  通过液体培养实验、滤纸片实验和固体平板培养实验来确定木葡糖酸醋杆菌(Gluconacetobacter xylinum)CGMCC 2955对氨苄青霉素、卡那霉素、硫酸庆大霉素、青霉素、硫酸链
  本实验通过提高培养基中无机氮磷水平同时降低有机氮磷水平,研究了无机氮磷对重组菌ZL1004红霉素发酵过程的影响.初始培养基中硫酸铵从0.3%增加到0.8%,豆粉从3.0%降到2.0%,同
会议
全媒体时代的到来,使传统媒体与新媒体不再以单一形式出现,创作者将报纸、广播、电视、互联网、手机媒体等组合的全媒体形式逐步融入新闻性电视专题片的创作中,影片以更新颖
相较于短视频,Vlog具有明显的自我意识,每一帧场景、每一条字幕均有自我披露,乡土情结、精神诉求、生活理念等遍在.文章以百家号为研究平台,选取典型的草根Vlog作为研究对象.
近年来,藁城市在调整种植结构中,示范推广了中棚甜椒栽培技术,获得了较好经济效益。2000年种植的 1000hm2(公顷). 667m2(亩)产甜椒 500kg(公斤)获产值4000元以上,其主要栽培技术是: 一、选用优种 选优质、抗病、耐
  研究可利霉素菌渣作为氮源的再利用,以减少其排放。基于菌渣的元素分析结果,以可利霉素效价为目标,研究可利霉素菌渣作为氮源的效果。元素分析表明,4%的菌渣中Ca、S、P、K