海洋占据地球表面积多达70％以上,在海洋中生活着十分丰富的生物种类,目前已知的生物种类中,有80％以上生活在海洋生态系统中,深海又占据了海平面的92.4％,是一个复杂且十分独特的生态系统.真菌是农作物的主要病原菌，位于植物三大类病害之首(真菌病害、细菌病害和病毒病害)。植物真菌病害难于防治、造成的损失严重，尤其是产毒真菌，不仅影响了作物生长，降低了产量，更重要的是产生能严重危害人类和动物健康的真菌毒素，如黄曲霉毒素、镰刀菌毒素等，具有强毒性、致癌性、致畸性、免疫抑制性等，据联合国粮农组织估计，全球每年约有25％的粮食受到真菌毒素的污染，造成经济损失数千亿美元，因此，产毒真菌的防控刻不容缓。利用拮抗微生物及其活性代谢产物防控植物病原真菌已成为生物防治领域的重要研究内容，并取得了可喜的成果，以往多是利用陆地微生物，而海洋微生物的研究较少，涉及到大洋深海微生物的研究就更少，但随着人们对深海微生物研究的不断深入，越来越多的高效抑制植物病原真菌的深海微生物资源将会被发现，并在生物防治领域发挥重要的作用。相对于太平洋等其他大洋，对南大西洋深海微生物的研究较少。我们利用细菌、放线菌、真菌等分离方法，对15个南大西洋深海沉积物样品中的微生物进行了分离培养鉴定和多样性分析，获得了1440株细菌、47株放线菌和29株真菌，分属于46个属127个种、10个属13个种和4个属14个种，并利用黄曲霉毒素产生菌为筛选模型，从中筛选出10个属20多个种深海细菌的95个菌株、1个属2个种深海放线菌的3个菌株和4个属11个种深海真菌的15个菌株的发酵无细胞上清液对黄曲霉毒素产生菌的菌丝生长和黄曲霉毒素产生的抑制效果在80-100%的新菌株，进而，对部分深海芽孢杆菌属细菌的液体发酵条件进行了优化，使发酵成本得到了明显的降低，为深海微生物资源在植物真菌病害的生物防治中的应用奠定了基础。