论文部分内容阅读
为了进一步了解该菌的代谢特性以及进行菌株改造，本文采用二代DNA测序技术平台(Illumina HiSeq 2000)测序了BA06菌株的基因组序列。使用ABySSl.3.4和Elena v3软件进行重头组装，分别产生23条和22条contigs(>200bp)。进一步用ABYSS组装的contigs BLAST由Elena组装的结果，通过手工检查的方式继续合并ABYSS组装的contig，并替换掉ABYSS组装的contigs中的N和其他不明确碱基，拼接得到的结果分别用ISGA和BAST两个注释系统进行注释。结果预测到3890条CDS，其中1830条CDS(占总CDS数量的48％,98条为假说蛋白)能被归于461个子系统之中，而另外的2060条CDS(占总CDS数量的52％,1178条为假说蛋白)不属于目前子系统数据库中的任何子系统。