解析多肽分子空间结构,评估标记分子与靶点多肽间的相互作用,是理解多肽的生物学功能,合理设计针对多肽靶点的药物的理论基础。目前通过传统的蛋白质结构研究手段,在获得高分辨结构的同时得到蛋白质、多肽与标记分子、药物间的结合力还存在着很大的挑战。基于扫描隧道显微技术(STM)超高的空间分辨能力,我们在分子水平上表征了人胰岛淀粉样多肽及其同系物在高定向热解石墨表面形成的组装结构。实验结果表明,人胰岛淀粉样多肽8-37 片段符合beta-发卡结构特征,Phe23/Gly24 和Ser20 是此发卡型beta-结构域的关键折叠位点。同时,利用STM 技术表征了标记分子四磺酸酞菁铜钠在一系列多聚氨基酸(八聚丙氨酸,八聚组氨酸,八聚酪氨酸,七聚谷氨酰胺)上的结合行为。通过统计标记分子在多聚氨基酸组装体上的吸附和分布特征,得到标记分子与不同种氨基酸间的相对亲和力。该工作为我们理解含有多个beta-结构域的多肽分子的折叠结构,评价标记分子、药物分子与多肽分子的相互作用机制提供了可行方法。