【摘 要】
:
为探讨磷虾目的系统进化关系,以磷虾目的50种磷虾为研究对象,分析其线粒体COⅠ基因片断序列,构建系统发育树,初步探讨了种属间亲缘关系.结果 显示,COⅠ基因可比序列长度为519bp,共包含258个变异位点,全部为碱基替换,无插入/缺失位点.四种碱基含量为A27.58%、T 35.47%、G 18.88%、C 18.07%,碱基A+T(63.05%)含量高于G+C(36.95%),表现出明显的T偏倚
【机 构】
:
中国水产科学研究院东海水产研究所,农业部海洋与河口渔业重点开放实验室,上海200090
【出 处】
:
第十届世界华人虾蟹养殖研讨会暨2016年中国河蟹产业发展高峰论坛
论文部分内容阅读
为探讨磷虾目的系统进化关系,以磷虾目的50种磷虾为研究对象,分析其线粒体COⅠ基因片断序列,构建系统发育树,初步探讨了种属间亲缘关系.结果 显示,COⅠ基因可比序列长度为519bp,共包含258个变异位点,全部为碱基替换,无插入/缺失位点.四种碱基含量为A27.58%、T 35.47%、G 18.88%、C 18.07%,碱基A+T(63.05%)含量高于G+C(36.95%),表现出明显的T偏倚.50种磷虾的种间遗传距离在0.065~0.306之间,其平均值为0.186,种内遗传距离范围在0-0.071之间,其平均值为0.017,种间距离约为种内距离的11倍,根据物种鉴定最小种间遗传距离0.020的观点,COⅠ基因序列间的差异能够很好地区分各磷虾种.基于COⅠ基因分别构建了3种系统进化树:邻接树(NJ),极大似然树(ML)及最大简约树(MP),它们拓扑结构基本一致,均可分为三大支系,假磷虾属均处于系统树的基部,是磷虾目中较早分化出来的一支,而包含种类最多的磷虾属则最后分支出来,表明其为磷虾类中相对较新的一个属.本研究比较全面地阐述了磷虾目50种磷虾的系统进化关系,结果表明,基于线粒体COⅠ基因构建的磷虾目分子系统树可以用来探讨磷虾种的分类单元的系统发育问题,具有重要的理论和现实意义.
其他文献
VEGF信号通路在高等动物中发挥着诱导内皮细胞增殖、促进细胞迁移及抑制细胞凋亡的功能,但是我们对VEGF信号通路在甲壳动物中的功能了解甚少.本研究分离并鉴定了凡纳滨对虾的三种VEGF基因:LvVEGF1,LvVEGF2和LvVEGF3.对其推导的氨基酸序列分析表明,它们均含有VEGF家族基因所共有的VEGF/PDGF结构域及CXCXC基序.组织表达分析显示,LvVEGF1主要分布于免疫器官Oka中
Na+/HCO3-共转运体(NBC)是一种可以转运HCO3-(或相关离子,例如CO32-)穿过细胞质膜的跨膜离子转运蛋白.以往的研究表明,NBC可能会对脊椎动物胞内pH调节发挥重要作用.在本研究中,NBC cDNA从南美白对虾(Litopenaeus vannamei)中分离得到并被命名为Lv-NBC.Lv-NBC cDNA全长为4479bp,包含59bp的5-非翻译区(UTR),835bp的3-
以凡纳滨对虾(Litopenaeaus vannamei)为研究对象,通过分子筛层析、Tricine-SDS-PAGE、Western-blotting、凝集实验、抑菌实验和Edman N端测序等方法探索血蓝蛋白酶解片段的凝集和抑菌活性.结果 发现,血蓝蛋白经胰蛋白酶水解后可产生分子量约为6-70kDa的7条片段,该酶解混合物对副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)具有显著的
本研究采用DGGE、高通量测序和生物信息学技术,对以凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)Toll(LvToll1)的SNPs及其免疫相关性进行了深入的研究.结果 发现,LvToll1在DGGE和高通量测序水平存在明显的单核苷酸多态性,其中LvToll1-V3在DNA水平存在错义突变位点145个,突变频率>1%的SNPs位点3个;在cDNA水平,存在错义突变位点38个,突变频率>1
甲壳动物神经内分泌-生理功能调控已成为目前国内外研究热点问题.在甲壳动物眼柄中X-器窦腺复合体(XO-SG)在结构和功能上类似于脊椎动物的下丘脑-神经垂体系统,合成与分泌多种神经肽激素,其中高血糖激素家族(CHH)是窦腺中含量最多的一类激素,具有调节能量代谢、免疫防御和渗透调节等多种功能.本文重组表达了凡纳滨对虾的高血糖激素,通过注射实验研究高血糖激素--免疫调控机制.实验梯度设置为:对照组(对虾
为了进一步探明谷胱甘肽系统对镉引起的氧化损伤的防御作用,本实验根据背角无齿蚌(Anodonta woodiana woodiana) 96h镉的半致死浓度,设置了5个染毒组(4.22,8.43,16.86,33.72,67.45 mg·L-1)和1个对照组,处理24、48、72和96h,测定鳃与肝脏中还原型谷胱甘肽(GSH)、氧化型谷胱甘肽(GSSG)含量和谷胱甘肽硫转移酶(GST)、谷胱甘肽还原
为了比较急性、亚慢性镉胁迫对河南华溪蟹(Sinopotamon henanense)卵巢组织抗氧化酶活性,和脂质过氧化水平的影响以及探究N-乙酰半胱氨酸(N-acetylcysteine,NAC)对其氧化损伤是否有缓解作用,本实验采用急性和亚慢性镉胁迫相结合的方法.急性组设置了对照组、7.25和14.5mg/L镉浓度处理3d、5d和7d;亚慢性组设置了对照组、0.725和1.45mg/L镉浓度处理
中华锯齿米虾广泛分布于亚洲淡水水域,因其体色丰富多样,自2003年开始成为一种重要的观赏虾。但是其体色的分子遗传基础尚未知。在观赏中华锯齿米虾中,红、黄和透明3种体色品系的体色遗传最稳定。这为进行体色分子机制研究提供了良好的材料。通过比较这3种体色品系的皮肤转录组,获得了红色与透明品系2292条差异基因,黄色与透明品系6158条差异基因。在所获得差异基因中,有75条果蝇或家蚕的同源基因已被证明与体
△9去饱和酶是不饱和脂肪酸合成通路中的关键酶之一,它能催化硬脂酸合成油酸,从而增加体内不饱和脂肪酸的含量.为探究低温条件下红螯光壳螯虾△9去饱和酶基因的表达机制,本研究利用RACE-PCR技术,从红螯光壳螯虾肝胰腺中克隆获得了△9去饱和酶基因的全长序列,该序列全长1236bp,开放阅读框长1041bp,编码346个氨基酸残基, 5端UTR长116bp,3UTR长79bp,3端含PloyA尾,初步确
拟穴青蟹是我国东南沿海地区重要的海水养殖蟹类,在当地养殖经济中占有较大比重.但其雌雄个体间的生物学特征和经济性状存在显著差异,对养殖的规模化具有一定影响.本研究对拟穴青蟹的精巢和卵巢组织进行去除核糖体反向富集转录组文库构建,采用Illumina Hiseq测序平台进行测序,将组装到的Unigene进行聚类并比对到Swiss-Pro、GO和KEGG数据库中注释,开展差异表达基因和差异lncRNA的分