大豆存在严重的连作障碍，连作时植株矮小，根系不发达，根瘤少且小，固氮功能低下，一年连作大豆减产一般都在１５℅￣３０℅之间，随着连作年限的增加，大豆产量下降越严重。作者已经报道自连作大豆根际土壤分离紫青霉菌产生毒素Ｒｕｂｒａｔｏｘｉｎｓ强烈抑制大豆的生长，可能是大豆连作障碍的关键因子。最近的研究进一步发现，紫青霉菌产生毒素极低浓度即可部分抑制大豆结瘤，用较高浓度毒素回接大豆时发现，大豆根毛发育受阻，根瘤菌对大豆根毛的吸附及形成的根毛卷曲的数量大大减少，或无法与根瘤菌相互识别，形成侵入线共生结瘤和共生固氮，因而处理株结瘤极少或完全不能结瘤固氮。同时侧根的发育也受到影响，从而成为造成连作大豆减产的主要因素，这一研究结果，为连作大豆进行综合调控，提高大豆产量提供了重要的科学依据。