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百萨偃麦草4J染色体含有蓝粒基因。蓝粒小麦富含花翠素类糖苷,对人类健康有益,同时,蓝粒基因表现很强的剂量效应和组织特异性,可以作为基因和染色体工程的重要标记基因,但迄今尚没有成功克隆小麦蓝粒基因的报道。我们前期通过配子电离辐射,已创制出稳定的4J变异体20多个,包括端体、等臂染色体、整臂易位、小片段易位、大片段易位和中间插入易位等,并初步构建了包含101个标记的4J物理图谱,其中定位于4JL的标记56个。本研究为精细定位和克隆蓝粒相关基因,首先,综合利用寡核苷酸探针套painting、GISH和分子标记对这些变异体进行了准确鉴定,除明确了易位染色体身份外,还揭示多条小麦染色体同时存在缺失或易位,说明寡核苷酸探针套painting、GISH和分子标记在综合鉴定复杂变异中的应用潜力;其次,与国外科学家合作,分拣并测序获得了端体4JL基因组序列70.7 Gb,通过初步拼接获得588 Mb的contigs,初步注释分析发现4JL包含1897个基因,其重复序列中反转录转座子含量最高,其次为DNA转座子;最后,以这些序列为基础,通过生物信息学分析,开发了百萨偃麦草基因组专化寡核苷酸探针4个和基因组SSR引物1000对,通过对其中357对引物进行分析,新开发4JL特异标记157个,并构建了包含200个标记的4JL物理图谱,将BaThb和17个特异标记共定位于两个蓝粒小片段易位的重叠区段,为蓝粒基因发掘提供了重要信息。