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采用改良的CTAB法提取19个樱花品种的基因组DNA。利用RAPD技术对19个樱花品种进行亲缘关系鉴定和品种分类研究。从60条10bp随机引物中筛选出32条扩增效果较好的引物进行扩增，共扩增出533条带，其中多态性带为406条，多态率达76.17％。根据扩增结果进行UPGMA聚类分析，得出反映各品种间亲缘关系的树状聚类图。聚类结果将19个品种分为2大类群，第1类群主要为杂交樱系；第2类群根据樱花的重瓣性、枝姿和花色又可分为不同的亚类群、类和亚类。种源、重瓣性、枝姿和花色都可作为樱花品种分类的重要指标。应用RAPD技术对樱花分子水平的分类结果与传统分类学的结果基本一致。