论文部分内容阅读
目的:我国结直肠癌(eolorectal cancer, CRC)的发病率均呈现上升趋势.单核苷酸多态(single nucleotide polymorphism,SNP)是最主要的遗传变异形式,是个体之间肿瘤易感性及治疗与药物反应性等生物学性状差异的重要遗传学基础.位于基因3非翻译区的SNP可能通过影响基因转录本与microRNA的结合能力,而影响目的基因的表达和个体的肿瘤易感性.本研究旨在探讨与CRC易感性相关的遗传因素.方法:我们首先通过数据库寻找CRC组织中差异表达基因,并搜寻基因3非翻译区位于microRNA结合位点的具有潜在生物学功能的SNP,在2003例CRC患者和2016例正常对照中进行病例-对照研究.基因分型采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术.SNP与CRC易感性的关联以logistic回归模型计算各基因型的比值比(OR)及其95%可信区间(CI)表示.采用双荧光素酶报告基因实验和实时定量PCR实验进行遗传变异的生物学功能研究.结果:生物信息学分析发现5个可能影响microRNA与基因转录本结合的SNP即KRAS rs1137188、KRAS rs7973450、KRAS rs9266、KRAS rs712和TLR4rs7873784.关联研究结果显示TLR4 rs7873784与CRC的发病风险显著相关,C等位基因(CC或GC基因型)携带者发生CRC的风险比GG基因型携带者降低30% (OR=0.70,95%CI=0.59-0.84;P=1.35×10-4).功能实验结果显示TLR4是hsa-let-7d-3p和hsa-let-7e-3p的靶基因,rs7873784 G>C遗传变异影响hsa-let-7d-3p和hsa-let-7e-3p对TLR4基因的表达调控.分子流行病学和功能研究相一致的结果强烈支持TLR4 rs7873784 G>C变异影响结直肠癌遗传易感性.结论:本研究发现TLR4 rs7873784遗传变异影响microRNA对基因的表达调控,并且影响CRC的易感性.这些研究结果对深入理解CRC的发生发展具有重要理论意义和潜在应用价值.