【摘 要】
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利用PCR技术分离克隆得到的中华乌塘鳢背部肌肉抗菌肽Hepcidin 基因片段,再采用5RACE和3RACE技术获得Hepcidin基因全长序列.该基因全长1122 bp,其中开放阅读框(ORF)长533 bp,编码90个氨基酸,是具2个跨膜区结构的亲水性不稳定蛋白;预测分子量为9856.6,理论等电点pI为7.51,分子式为C434H675N115O121S13;无规则卷曲是其蛋白质二级结构的主
【机 构】
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泉州师范学院湿地研究所 广西红树林研究中心
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利用PCR技术分离克隆得到的中华乌塘鳢背部肌肉抗菌肽Hepcidin 基因片段,再采用5RACE和3RACE技术获得Hepcidin基因全长序列.该基因全长1122 bp,其中开放阅读框(ORF)长533 bp,编码90个氨基酸,是具2个跨膜区结构的亲水性不稳定蛋白;预测分子量为9856.6,理论等电点pI为7.51,分子式为C434H675N115O121S13;无规则卷曲是其蛋白质二级结构的主要元件,在氨基酸多肽链上有8个二硫键位点.三维结构模型预测结果显示该含4个β折叠构成和一些无规则卷曲构成.并对广西珍珠湾湿地野生型、红树林原位生态养殖型、池塘人工养殖型三种生态型的雌雄个体进行相似大小随机并重复取样,利用定量PCR技术,分析中华乌塘鳢鱼肉Hepcidin基因在不同生态型及不同性别个体的表达差异.
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