[目的]本实验旨在对猪肠外致病性大肠杆菌进行分离鉴定的基础上对其全基因组序列进行测定,并对其携带的耐药基因进行筛选,以期为猪肠外致病大肠杆菌耐药机制的进一步研究奠定基础。[方法]采用分子生物学鉴定方法对1株肠外致病性大肠杆菌进行分离鉴定,并采用平皿二倍稀释法测定4种临床常用抗菌药物(氟苯尼考、强力霉素、环丙沙星、阿米卡星)对其体外最小抑菌浓度(MIC)；提取此菌株基因组构建PairedEnd测序文库,并运用Illumina公司Hiseq2000高通量测序系统进行测序,将测序结果与NCBI的nr库进行Blast比对筛选耐药基因。[结果]分离鉴定获得了1株猪源肠外致病性大肠杆菌,4种临床常用抗菌药物对该株菌的MIC值均较高。经全基因组测序获得了相当于基因组大小100倍覆盖度(按照基因组≤5Mb计算)的测序数据,对其耐药基因分析结果显示,测序筛选出外排调控基因MarC、SoxR,外排泵MATE和ABC基因,耐药基因移动原件IS,四环素耐药基因tet,氟苯尼考耐药基因FloR及氯霉素乙酰转移酶等。[结论]该株猪源肠外致病性大肠杆菌对临床常用抗菌药物(氟苯尼考、强力霉素、环丙沙星、阿米卡星)均耐药,其基因组中携带有介导外排和介导四环素类、氯霉素类耐药的基因。