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近几年来，北京中医药大学国家自然科学基金申报项目逐年增加，项目获资助率也有了较大的提高，从2003年获资助9项到2006年获资助29项。获资助项目数的增加，给依托单位基金管理工作者提出了严峻的课题，如何管理好日益增多的课题，如何让每一位项目负责人认真、按计划完成课题，一个有效、可行的评估方法的产生势在必行，本文运用成本--效果分析方法来评价课题完成情况，对项目的绩效评估进行了方法学上的尝试。本文首先介绍了资料与方法，然后详细讲述了投入--产出比指标体系和权重的建立与评估结果。