目的 通过对先天性直肠肛门畸形大鼠盆底部结构的二维核磁图像进行分析处理，得到其三维结构图像，探讨该方法应用于直肠肛门畸形动物研究的价值.方法 将受孕Wistar 雌鼠在其受孕第10 天喂以乙烯硫脲，妊娠22 天左右产仔，选取鼠崽中的畸形幼鼠，通过Bruker 4.7T 超导型磁共振扫描成像仪对所有幼鼠进行盆底部行横断位、矢状位、冠状位扫描，得到其盆底部结构的二维图像，通过测量工具进行耻骨直肠肌、肛门内括约肌、肛门外括约肌等结构的比较.将核磁图像导入到三维重构软件中进行处理，通过图像切割、渲染等处理，得到幼鼠盆底三维结构图像.结果 获得所有畸形鼠崽直肠肛门畸形大鼠盆底部结构的矢状位、冠状位和横切面的MRI 图像，通过软件测量分析横纹肌复合体的平均厚度，可以发现ARM 幼鼠的横纹肌复合体厚度较正常幼鼠薄弱(P ＜ 0.05).通过三维结构重建，从空间角度观察直肠闭锁形态、瘘管位置、周围组织器官形态以及围绕直肠周围的横纹肌复合体的发育情况.结论 通过磁共振成像，可以无创、清晰的显示出直肠肛门畸形幼鼠盆底的解剖形态，三维重构该形态可以更直观的表现出畸形动物各器官的空间形态及其之间的毗邻关系，从而使得在进行直肠肛门畸形动物研究中，能够从空间的角度去观察动物.