【摘 要】
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实验是采集四种南极鱼各三个皮肤样本,以16S rDNA作为分子标记,采用高通量测序技术分析了四种南极鱼皮肤微生物的多样性的。测序结果共获得716个OTU,26个门,50个纲,116个目,2
【机 构】
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上海海洋大学海洋科学学院; 大洋渔业资源可持续开发省部共建教育部重点实验室; 国家远洋渔业工程技术研究中心; 远洋渔业协同创新中心;
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实验是采集四种南极鱼各三个皮肤样本,以16S rDNA作为分子标记,采用高通量测序技术分析了四种南极鱼皮肤微生物的多样性的。测序结果共获得716个OTU,26个门,50个纲,116个目,217个科,408个属531个种。分析发现,四种南极鱼中TB和PB微生物菌群的差异性显著(P<0.05)其余两组间的差异不显著(P>0.05),但四种鱼在门水平上具有各自的特异性菌群,鱼体皮肤微生物环境与南极环境中微生物相比具有较大差异。由于鱼体的皮肤表面是鱼体接触水环境中微生物的第一道屏障,而鱼体的皮肤与鱼体寄生微生物和水体环境中微生物具有密不可分的关系,本实验通过分析鱼体皮肤微生物的多样性为研究微生物菌群对鱼体免疫系统的影响打下基础。
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