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植物分子标本的处理方式直接影响所提取植物总DNA 的品质和总量。理想的分子标本处理方式是使用新鲜的材料，低温干燥或超低温(如液氮速冻)保存，但这两种方法在野外均不便实施。当前通常采用自然阴干法在野外保存苔藓植物，这样处理过的标本DNA 容易降解；硅胶干燥法保存分子标本较为常见，但硅胶在野外采集中不便大量携带，且循环使用硅胶有污染标本的可能性。