2009年7月份测定了九龙江河口水体和沉积物中甲烷浓度，并对其甲烷浓度分布特征和来源进行了研究。测定结果显示九龙江河口表层水中甲烷浓度在10．7～456．7nmol／L之间，饱和度远超过大气平衡甲烷浓度。表层水中甲烷浓度由河口上端向中下端快速减小，主要反映了河口下端低浓度甲烷海水和河口上端高浓度甲烷水的混合作用。沉积物孔隙水中甲烷浓度在水平分布上与水体甲烷浓度变化趋势一致，从河口上端淡水沉积区向海相区逐渐减小，在垂直剖面上B2和B3站位甲烷浓度随深度增加逐渐增大。由于河口上端沉积物中富含有机质和低的硫酸盐浓度，产甲烷菌降解发酵后的有机质产生大量的甲烷。河口下端海相区随着沉积物孔隙水中硫酸盐浓度增加，沉积物中产甲烷过程逐渐受到硫酸盐还原过程的抑制，同时，沉积物下部产生的甲烷在硫酸盐-甲烷过渡带中被甲烷厌氧氧化消耗，相应通过沉积物-水界面扩散进入水体的甲烷量减小。九龙江河口水体和孔隙水中甲烷浓度的空间分布暗示水体甲烷主要来自河口上端盐度相对较低且富有机质的红树林潮间带湿地和泥滩，并通过沉积物-水界面的扩散进入上覆水体。