牛病毒性腹泻病毒(Bovine viral diarrhea virus.BVDV)引起牛病毒性腹泻粘膜病,其感染可引发多种临床疾病,包括呼吸系统、消化系统、生殖系统疾病、免疫抑制,还可导致混合感染和继发感染,给养牛业造成巨大经济损失.然而,目前关于该病毒与宿主细胞之间相互作用的分子机制尚不清楚,有待深入研究.本研究利用RNA-Seq测序技术分别对致细胞病变型和非致细胞病变型BVDV感染MDBK细胞24h后细胞mRN的表达变化进行分析，初步发现，非致细胞病变型BVDV引起宿主细胞上调基因为976个，下调基因798个;致细胞病变型BVDV引起宿主细胞上调基因为839个，下调基因639个;对这些差异基因的功能和Pathway进行显著性富集分析，初步筛选出不同生物型BVDV在细胞自噬、细胞凋亡、免疫调节因子、NF-KB Wnt信号通路等相关的差异表达基园;利用qPCR方法对选择的差异表达基因进行验证，两种方法检测具有较高的符合率。通过在转录组水平上对不同生物型BVDV感染易感细胞的相互作用的动态特性进行分析，发现不同生物型病毒与宿主细胞基国相互作用的差异，为进一步揭示病毒致病的分子机制奠定基础。